Décembre 1996 : Décision des Etats Généraux de l’enseignement catholique d’étendre sa mission à l’enseignement supérieur ;
2001 -2003 : Mise en place par le Secrétariat National de l’Enseignement Catholique (SNEC) sous l’inspiration des Pères Évêques de la Conférence Episcopale Burkina-Niger (CEBN), d’une commission pour la création d’une université catholique ;
Juillet 2004  : Autorisation d’ouverture de l’USTA accordée par l’arrêté n°2004-141/MESSRS/SG/DGESRS/DES du 20 juillet 2004 ;
Septembre 2004 : Nomination du Pr Albert OUEDRAOGO en qualité de Recteur de l’USTA ;
Octobre 2004 : Ouverture des portes de l’Université Saint Thomas d’Aquin à saaba sur le site du Centre de Formation Pédagogique et Pastorale (CFPP) avec trois (03) établissements : la FSJP, la FASEG et l’ISMT ;
Janvier 2006 : Acquisition du site principal de l’USTA d’une superficie de 11ha à saaba abritant le siège actuel ;
Octobre 2006 : Ouverture du quatrième établissement de l’USTA : La Faculté de Médecine ;
Octobre 2006 : Déménagement partiel de l’administration et début des cours sur le site principal de l’USTA ;
Septembre 2008 : Nomination du Pr Jacques SIMPORE en qualité de Recteur de l’USTA ;
Septembre 2008 : Signature d’une convention de partenariat avec l’Université Catholique de Lille pour l’ouverture d’un Master en Banque Finance à l’USTA ;
Novembre 2009 : Reconnaissance par le CAMES de tous les huit (08) diplômes présentés par l’USTA au 24ème colloque sur la reconnaissance et l’équivalence des diplômes à Bamako (Mali) ;
Décembre 2009 : Acquisition d’un site de 41ha pour le Centre Hospitalier Universitaire Saint Thomas d’Aquin (CHU-USTA) ;
Juin 2010 : Sortie des premières promotions en économie - gestion, droit et finance comptabilité de l’USTA ;
Juillet 2010  : Création de la Fondation Université Saint Thomas d’Aquin (Fondation USTA) à travers le récépissé N° 2010 - 363/MATD/SG/DGLPAP/DOASOC de déclaration d’existence ;
Octobre 2011 : Ouverture du cinquième établissement de l’USTA : La Faculté des Sciences et Technologie ;
Octobre 2011 : Ouverture du sixième établissement de l’USTA : La Faculté des Sciences de l’Homme et de la Société en partenariat avec le Grand Séminaire Saint Pierre et Saint Paul de Kossoghin ;
Décembre 2011 : Acquisition d’un terrain à la ZAD II pour les formations continues ;
Novembre 2012 : Reconnaissance par le CAMES de tous les trois (03) diplômes présentés par l’USTA au 27ème colloque sur la reconnaissance et l’équivalence des diplômes à Niamey (Niger) ;
28 juin 2014 : Sortie de la première promotion des médecins entièrement formés à l’USTA ;
24 janvier 2015  : Commémoration des 10 ans de l’USTA de janvier 2014 – janvier 2015 ;
Décembre 2015 : Reconnaissance par le CAMES du diplôme de médecine présenté par l’USTA au 30ème colloque sur la reconnaissance et l’équivalence des diplômes à Dakar (Sénégal) ;
Décembre 2016 : Reconnaissance par le CAMES de tous les trois (03) diplômes présentés par l’USTA au 31ème colloque sur la reconnaissance et l’équivalence des diplômes à Ouagadougou (Burkina Faso) ;